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已主持项目40多项，其中国家科技基础条件平台重大项目3个，国家科技基础性工作重大项目2个，“十五”国家重点科技攻关课题2个，“八五”“九五”国家重点科技攻关专题3个，973子课题3个，农业部项目11个，国际合作项目7个。现主持国家科技基础条件平台重大项目“国家植物种质资源平台建设”
、“国家农作物种质资源野外观测研究圃网建设”、“国家作物科学数据共享中心建设”等。
研究成果“中国作物种质资源收集保存评价与利用”获国家科技进步一等奖，《国家农作物种质资源数据库系统》获国家科技进步三等奖，《中国主要农作物种质资源地理分布图集及其电子地图系统》获农业部科技进步一等奖。科技部等四部委联合颁发的国家科技攻关优秀成果奖两项。荣获中国农学会第三届青年科技奖，中国农科院首届十佳青年。
主编《中国主要农作物种质资源地理分布图集》（中英文）、《植物染色体和同工酶图象分析》、《农业数据库系统程序设计》、《自然科技资源共性描述规范》、《自然科技资源共享平台建设的理论与实践》、《农作物种质资源基本描述规范和术语》六部专著共400多万字,
出版《遗传资源信息汇编指南》译著一部，参编著作15部。在国内外学术刊物上发表论文100多篇。
提出并建立了种质资源数据可靠性保证体系,制定了农作物种质资源描述规范、数据标准和数据质量控制规范制定的原则和方法，组织制定了80种作物的240个规范标准，组织编写并出版了《农作物种质资源技术规范》丛书110册；建成了拥有180种作物、39万份种质信息的国家农作物种质资源数据库；研制了中国作物种质资源多介质存贮系统;
建成了第一个中国作物种质信息网，研制了基于Internet的种质资源数据库查询系统和数据评价系统，使我国的种质信息管理达到国际先进水平。
研制成功了中国作物种质资源电子地图系统，绘制了272幅各种类型种质资源地理分布图,明确了我国84种作物种质资源的分布规律和富集程度，首次编制出版了《中国主要农作物种质资源地理分布图集》（124万字），这是世界上第一部反映种质资源地理分布的科学专著；研制成功了中国主要农作物种质资源特性分布信息系统，绘制了5大作物种质资源特性分布图241幅；研制成功了主要作物种质资源WebGIS和CropGIS。
研制成功了指纹图谱自动识别系统（GEL），可供种子质量检测、品种认定、亲本分类及遗传多样性研究应用。
建成了种子储藏习性数据库管理系统(SSB),为各国科学家随时查询和了解各物种的分布、种子贮藏特性等提供了极大便利。建成了种质库种子繁殖更新专家系统（RES），为种质库的安全保存提供重要依据。设计了国际植物遗传资源信息交换软件DIPVIEW，可用于植物遗传资源数据的交换，国际、地区和国家级植物遗传资源数据的管理、电子目录的出版、植物信息网的建立等。DIPVIEW、SSB、RES已在许多国家推广使用。
研制了农作物种质资源分类管理信息系统，为种质资源的对外交换和确保我国资源安全提供了技术支撑。研制了农业野生植物GIS/GPS，为我国农业野生植物的管理、保护和利用提供了新的手段。研制了中国农作物审定品种信息系统（CVIS），使我国审定品种信息管理开始走上标准化和规范化的轨道。研制了农业植物新品种保护审查管理系统，为植物新品种的审查和保护奠定了基础。
建立了国家作物科学数据中心，研制了国家作物科学数据共享网络系统，为农业科技创新、政府决策等提供了数据支撑。
制定了自然科技资源分级归类与编码标准、植物种质资源共性描述规范、国家科学数据共享工程质量管理规范、国家野外试验站信息共享管理办法、国家野外试验站数据分级分类和编码标准、国家野外试验站观测数据标准等一系列规范性文件。研制了国家科学数据共享工程门户网站用户管理系统，建立了中国可持续发展信息网农业分中心，建成了青稞等西藏主要农作物种质资源信息共享服务系统。
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